因應丹娜絲颱風可能帶來的風雨，臺北捷運公司持續依據防颱防洪SOP，展開防颱布署及應變準備，確保颱風期間捷運系統和旅客安全，並持續密切注意颱風動向。颱風期間營運訊息將透過臺北市政府及臺北捷運公司網站、「台北捷運Go」App、車站旅客資訊系統、廣播系統、現場公告及媒體宣導等方式公告。
臺北捷運公司持續依據防颱防洪SOP，展開防颱布署及應變準備，確保颱風期間捷運系統和旅客安全淡水信義線、松山新店線（小碧潭站）、文湖線等路線的高架與平面段，當實際瞬間風速達10級風以上，或10分鐘內之平均風速達7級風時，即依照標準作業程序暫停營運；中和新蘆線、板南線、松山新店線，以及淡水信義線等地下段部分，將繼續運轉，並依人潮狀況彈性調整營運班距。
為預防颱風帶來的雨勢，捷運全系統如捷運機廠、車站、停車場及地下商店街，均已加強檢視各項防洪設備，如防洪閘門、抽水機等，並完成防颱整備作業。
長達7個月的防汛期(5月至11月)，北捷持續啟動各場站防汛整備及強化防汛設施設備檢視、測試作業，無論小如手提式抽水機，大至隧道內全斷面防水隔艙閘門，均有完整保養測試及訓練SOP，確保防洪設施設備功能妥善運作。颱風期間也將透過中央氣象署及經濟部水利署網頁監看即時雨量，另隨時監測捷運周邊河川如基隆河、新店溪、大漢溪水位警戒情形，納入營運模式及是否停止營運參考。
臺北捷運各車站出入口，依捷運防洪設計高程為200年頻率洪水位加高110公分，提升防洪能力，另部分重要車站隧道設置有防水隔艙閘門，避免因捷運隧道經過斷層帶、過河段或出土段等可能湧水處，造成洪水侵入隧道並漫延至捷運沿線各車站，形成重大損失。
