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蜂蜜出現乳白色或顆粒狀的結晶，是一種自然的物理現象，不是變質反而是純正蜂蜜的「最佳證明」，利用40℃至50℃溫水隔水加熱，即可恢復液態，消費者亦可當抹醬食用增添口感，千萬別誤以為壞掉而丟棄。
蜂蜜結晶的成因是蜜蜂在釀蜜時將蔗糖轉化為葡萄糖及果糖，這些糖類佔蜂蜜成份60%至80%，蜂蜜採集後為利保存，會在50℃真空環境下去除水分至20%以下，所以蜂蜜其實是富含葡萄糖和果糖的過飽和溶液，當環境溫度降至約14℃左右，蜂蜜中的葡萄糖分子會聚集，逐漸形成細緻的晶體，這並非變質或摻假，而是蜂蜜天然成分的物理變化。
蜂蜜理想的保存方式是「常溫、陰涼、乾燥」，並以玻璃瓶或食用級塑膠容器填裝，避開陽光直射處，取用時建議使用「乾淨且完全乾燥」的餐具，避免交叉污染。蜂蜜儲藏於4℃至5℃冷藏庫會加速結晶，當結晶時，可置於40℃至50℃溫水中隔水加熱慢慢攪拌即可恢復，或直接當抹醬食用增添口感，切勿使用高溫或微波方式加熱，容易破壞蜂蜜的營養及香氣。
自109年起農糧署推動蜂產類產銷履歷制度，透過逐批檢驗嚴格管控，確保品質安全及來源可追溯性；另該署輔導台灣養蜂協會核發「國產蜂產品證明標章」，是符合CNS1305蜂蜜國家標準，標章採大圖示、鮮明配色重新設計，並通過經濟部智慧財產局審核，已於本(115)年1月開始核發推廣使用。消費者選購時，只須認明「產銷履歷」 或「國產蜂產品證明」標章，即是國產蜂蜜。#
