基隆捷運為北北基共同推動的重大交通建設，將提供市民安全便捷的通勤服務。然而，115年度公共建設計畫行政院僅核列補助基隆市經費3億6,981萬2千元，相較於114年2月24日所提報之經費短少11億1,175萬8千元，對市府財政造成沉重壓力。
「基隆南港間通勤軌道建設計畫」綜合規劃報告已於113年1月31日奉行政院核定，計畫總經費696.89億元，中央補助北北基三市共計519.98億元。新北市政府捷運工程局於114年2月24日向交通部提報115年基隆捷運經費概算，申請中央補助款共36億1,196萬6千元，基隆市分配額度為14億8,157萬元，惟交通部鐵道局於114年8月25日發函，「基隆南港間通勤軌道建設計畫」 115年度補助款，行政院僅准核列9億305萬元，含臺北市政府7,818萬4千元、新北市政府4億5,505萬4千元、基隆市政府3億6,981萬2千元 ，將造成基隆市龐大財務缺口。
基隆市政府已與新北市政府召開會議研商因應措施， 未來3市將共同面對不讓工進受影響外，並鄭重呼籲中央，基隆捷運攸關北北基廣大通勤民眾的便利與福祉，應儘速補足減列之經費，以確保捷運推動進度不受影響。基隆市政府將持續爭取各方支持，全力推展捷運建設，讓市民早日享有更便捷、安全的公共運輸服務，徹底改善基隆至雙北間長久以來的通勤瓶頸。
